Konference Open Science II

Hlavní projektový manažer projektu EOSC-CZ, integrační manažer české e-infrastruktury e-INFRA CZ a výkonný ředitel jednoho z jejích tří partnerů, infrastruktury CERIT-SC zřízeného při ÚVT MU. V rámci svých aktivit vedl budování platformy pro koordinaci řízení IT služeb na MUNI, prostředí pro správu citlivých dat SensitiveCloud a další. Jeho výzkumné aktivity se zaměřují na správu a analýzu komplexních a vysoce dimenzionálních dat za pomocí technik AI.

pracuje ve sdružení CESNET, kde je vedoucím výzkumně-vývojového týmu zabývajícího se nástroji pro podporu kybernetické bezpečnosti. Má mnohaleté zkušenosti ve výzkumu a vývoji v oblasti monitorování síťového provozu, kybernetické bezpečnosti a sdílení threat intelligence a účastnil se řady národních i mezinárodních projektů.

Specializuje na repozitářový systém ASEP. Věnuje se tématům otevřené vědy, datového managementu a otevřeného akademického softwaru. Přednáší o tématech správy dat a správného datového managementu. Navrhuje architekturu nového ASEP API. Je součástí týmu metodiků základních repozitářových systémů Národní repozitářové platformy (NRP).

Metodička repozitářového systému CESNET Invenio v projektu NRP. Jejím úkolem je provázet uživatelské komunity procesem vytváření nového doménově specifického repozitáře v prostředí NRP. Má také zkušenosti s vytvářením repozitářů pro humanitní vědy v repozitářovém systému Islandora v infrastruktuře Digitalia MUNI ARTS a je součástí týmu, který pracuje na pilotním repozitáři ArchaeoVault.

Vede Core Facility Bioinformatiky na CEITEC MU. V rámci ELIXIR CZ zastává pozici strategického vedoucího oblasti humanních dat a je hlavním přispěvatelem do projektu Genomic Data Infrastructure. V projektu Open Science II koordinuje budování repozitáře OmiCZ, vyvíjeného ve spolupráci s partnery ELIXIR CZ jako součást EOSC CZ. Podílí se také na implementaci Trusted Research Environments, včetně integrace s evropskou federovanou archivační infrastrukturou FEGA.

Biochemik působící na Ústavu fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR, zaměřený na zobrazování imunitních buněk a správu dat ve výzkumu. Od roku 2022 je ambasadorem Research Data Alliance pro oblast materiálových věd a inženýrství. V iniciativě EOSC CZ předsedá příslušné pracovní skupině a vede tým zaměřený na automatizovanou správu dat. Je také garantem repozitáře DANTEc pro materiálové vědy a příbuzné obory.

Absolvent informatiky na MFF UK, kde se habilitoval v matematické lingvistice a později byl jmenován profesorem. Dlouhodobě se věnuje výzkumu na pomezí lingvistiky, matematiky, statistiky a informatiky, zejména syntaktické analýze, strojovému překladu a jazykovým databázím. Působil v Česku i zahraničí (např. Johns Hopkins University, IBM Research). Je ředitelem Ústavu formální a aplikované lingvistiky MFF UK a koordinátorem infrastruktury LINDAT/CLARIN.

Specializuje se na repozitářový systém CLARIN-DSpace. Věnuje se datovým analýzám, správě výzkumných dat a jejich anonymizaci. Podílí se na metodické správě institucionálního repozitáře výzkumných dat Univerzity Karlovy. Je součástí týmu metodiků základních repozitářových systémů Národní repozitářové platformy (NRP).

Působí ve výzkumném centru NTIS, Fakulty aplikovaných věd, ZČU v Plzni. Jejím hlavním zájmem je výzkum IT nástrojů, informačních systémů a datové vědy v rámci projektů kolaborativního výzkumu s partnery z aplikační/soukromé sféry a výzkumu smluvního, a to především v souvislosti podpory rozhodování v technické praxi a medicíně. Kromě samotného výzkumu se zaměřuje i na další specifika vycházející z takovéto spolupráce.

Ředitel Sociologického ústavu AV ČR. Sociolog, zaměřuje se na metodologii, kvalitu dat a výzkumné infrastruktury. Založil a vedl Český sociálněvědní datový archiv. Vedl jeden ze čtyř strategických pilířů CESSDA ERIC, který byl zaměřený na rozšiřování a externí spolupráci. Je členem Social Sciences and Humanities Strategy Working Group při ESFRI a členem Rady pro velké výzkumné infrastruktury při MŠMT. Je národním koordinátorem ISSP a členem ISSP Methodology Committee.

Věnuje se informační vědě se zaměřením na informační praktiky, organizaci vědění a informační etiku v kontextu správy a zpřístupňování dat v digitálních humanitních vědách. Ve své práci se soustředí na datové, paměťové a anotační praktiky a jejich roli při tvorbě, interpretaci a sdílení dat. Je autorem a spoluautorem studií zaměřených na digitální archivy, výzkumné infrastruktury a správu dat. Podílí se na rozvoji infrastrukturních řešení v rámci LINDAT/CLARIAH-CZ, konkrétně v uzlu Digitalia MUNI ARTS.

Vedoucí Laboratoře pro náročné datové analýzy a simulace v IT4Innovations. Zaměřuje se na pokročilé zpracování dat s využitím AI a strojového učení, vývoj orchestrace pro HPC/Cloud/Big Data a zjednodušení přístupu k výpočetní infrastruktuře včetně distribuce dat. Dlouholeté zkušenosti s vedením národních i mezinárodních projektů. Koordinoval evropský projekt LEXIS zaměřený na zpracování velkých dat pomocí superpočítačů a cloudu a navazující projekt EXA4MIND.

V současnosti působí jako ředitel Centra CERIT-SC a člen správní rady e-INFRA CZ. Od roku 2021 je předsedou představenstva Elixir CZ a je zástupcem české vědy v představenstvu Elixir. Po působení v řídicí radě EOSC nyní zastupuje CESNET, českou pověřenou organizaci EOSC-A, a podílí se na strategickém rozvoji EOSC v ČR. Dlouhodobě se zapojuje do národních i mezinárodních projektů, často jako vedoucí národních týmů. V poslední době se podílel na EOSC-Future, EOSC-Life a GDI.

Vystudoval anglistiku a český jazyk a literaturu na FF MU. Od roku 2004 působil v Centru informačních technologií FF MU, kde se podílel na práci s jazykovými korpusy, e-learningu a budování infrastruktury Digitalia MUNI ARTS. V současnosti pracuje jako IT architekt v CERIT-SC při ÚVT MU, zaměřeném na datově náročný výzkum. V projektu NRP vede aktivitu pilotních repozitářů, které testují řešení pro správu, sdílení a dlouhodobé uchovávání výzkumných dat v souladu s FAIR principy.

Botanik a vedoucí herbářových sbírek Univerzity Karlovy, který studuje diverzitu a rozšíření rostlin, a využití herbářů i mimo taxonomické účely. V rámci NRP koordinuje tvorbu repozitářů biodiverzitních dat.

Dnes vede Katedru softwarového inženýrství MFF UK, kde vyučuje softwarové inženýrství a architekturu. Jako datový expert spolupracoval s ministerstvem vnitra, od roku 2024 ve spolupráci pokračuje s DIA, na níž úkoly spojené s digitalizací veřejné správy přešly z ministerstva. Byl zapojený v evropských výzkumných projektech, spolupracoval s komerční sférou. Působil jako hostující profesor na University of Passau v Německu. Od roku 2026 působí jako prorektor UK pro IT a digitalizaci.

Věnuje se problematice botanických databází a baví ho nacházet cesty k integraci již existujících řešení. Zajišťuje vývoj herbářového repozitáře.

Data steward na CEITEC Masarykovy univerzity, kde se zaměřuje na správu výzkumných dat a implementaci principů FAIR. Podílí se na vývoji národního datového repozitáře pro simulace molekulární dynamiky a podporuje výzkumníky při zavádění osvědčených postupů pro správu a sdílení komplexních vědeckých dat. Jeho doktorský výzkum se zaměřuje na to, jak lze data z molekulární dynamiky standardizovat a sdílet reprodukovatelným a strojově zpracovatelným způsobem.

Působí jako výzkumný pracovník na ÚVT MU, kde vede oddělení pokročilé správy dat. Dlouhodobě se věnuje správě, ochraně a zpřístupňování výzkumných dat a koordinuje aktivity v oblasti otevřených a FAIR dat na MU. V síti OpenAIRE zastává roli vedoucího Czech National Open Access Desk a je členem její výkonné rady. V projektu NRP vede pracovní balíčky zaměřené na služby pro FAIR data a v rámci Open Science II se podílí na budování služeb pro Trusted Research Environments pro práci s citlivými daty.

Působí jako kurátorka a správkyně vznikajícího Pilotního repozitáře pro data ze zobrazovací biologie. V projektu NRP má na starosti modelářskou, koordinační a organizační agendu repozitáře. Zaměřuje se na vše, co předchází a následuje po samotném technickém vývoji: vytváří konceptuální metadatový model, zpostředkovává zapojení vědecké komunity do procesu tvorby repozitáře, řeší administrativní i legislativní aspekty.

Vedoucí knihovny Historického ústavu Akademie věd ČR, kde se současně věnuje koordinaci agendy otevřené vědy a správě výzkumných dat. Ve své odborné činnosti se mimo jiné zaměřuje na problematiku implementace principů otevřené vědy a tvorbu DMP v prostředí humanitních věd, zvláště pak v historii. Vystudovala historii se zaměřením na hospodářské dějiny a dějiny vědy a techniky na Filozofické fakultě UK. Ve volném čase se věnuje mimo jiné molinologii, mixologii, badmintonu a hře na bicí.

Pracuje v Sociologickém ústavu AV ČR v oddělení ČSDA a zároveň působí ve sdružení CESNET, kde se podílí na rozvoji NDI. Dlouhodobě se věnuje FAIRifikaci výzkumných dat, jejich správě, sdílení a znovuvyužití. Aktivně se zapojuje do národních i mezinárodních iniciativ v oblasti Open Science a EOSC, kde se podílí na rozvoji metodik a nástrojů pro implementaci FAIR principů. Současně se věnuje komunikaci výsledků vědy a podpoře otevřeného přístupu k výzkumným datům.

Bude upřesněno

Pracuje jako datový analytik ve Fyzikálním ústavu AV ČR. Od listopadu 2025 se podílí na rozvoji repozitáře Fyzika, který je postaven na platformě Invenio RDM. Je absolventem VŠE a jeho profesní zázemí vychází z oblasti reportingu, automatizace a datové analýzy. V rámci projektu Open Science II zastává roli správce repozitáře a podílí se na jeho provozu i dalším rozvoji. Součástí jeho činnosti je také spolupráce na tvorbě metadatových modelů experimentálních dat.