Bio/zdraví/potraviny
Tato pracovní skupina integruje instituce a výzkumné infrastruktury z oblasti biologických a lékařských věd, potravinářství a výživy. Jejím cílem je vytvoření rámce a nastavení parametrů pro implementaci EOSC v ČR v tomhle oboru.
Pokrývá širokou škálu vědeckých disciplín, a to od základního výzkumu se systémově biologickými přístupy, přes translační a klinický výzkum, nové biotechnologické specializace, až po oblast potravin a výživy z hlediska jejich bezpečnosti a jakosti. Cíleně také mapuje kapacity existujících datových zdrojů v této oblasti, jejich metadatové standardy a nastavené postupy pro správu, kurátorství, sdílení a přístup k těmto zdrojům.
Pracovní skupina se prolíná s oblastmi environmentálních, sociálních a humanitních věd řešících zdravotní dopady dalších faktorů, jakými jsou životní prostředí a jeho degradace nebo změny socioekonomických poměrů. Důležitou spolupráci představuje také napojení na pracovní skupinu Citlivá data, které rozvíjí komplexní řešení etických a právních požadavků na sdílení dat a ochranu soukromí v těchto vědních oborech.
Vedoucí skupiny:
- Jiří Vondrášek, Ústav organické chemie a biochemie AV ČR / ELIXIR-CZ
Zástupce vedoucí supiny:
- Radka Svobodová, Masarykova univerzita
Tajemnice:
- Lenka Sedlačková (lenka.sedlackova@cesnet.cz)
Klíčové aktivity a hlavní plánované výstupy Open Science II
Klíčová aktivita 2 – Tematického clusteru Bio/zdraví/potraviny (Jiří Vondrášek)
- 2.1 Národní omický repozitář – Czech Omics Node (OmiCZ)
- Vojtěch Bystrý (vojtech.bystry@ceitec.muni.cz)
- 2.2 Repozitář strukturní a simulační data (BioSimCZ)
- Radka Svobodová (radka.svobodova@ceitec.muni.cz; radka.svobodova@ceitec.muni.cz)
- 2.3 Repozitář pro lidská i animální obrazová a fyziologická multimodální data (Imaging repozitář)
- Michal Mikl (michal.mikl@ceitec.muni.cz); Jan Fousek (jan.fousek@ceitec.muni.cz)
- 2.4 Repozitář pro data chemické biologie a jeho propojení s vývojem a tréninkem AI modelů MS
- Jakub Galgonek (jakub.galgonek@uochb.cas.cz)
- 2.5 Tvorba nového repozitáře ClinData a FAIRifikace dat
- Michaela Bendová (michaela.bendova@upol.cz); Marián Hajdúch (marian.hajduch@upol.cz)
- 2.6 Standardizace a nastavení postupů pro ukládání a správu přístupu k datům
- Jakub Jamárik (jakub.jamarik@med.muni.cz)
- 2.7 Vývoj a pilotní zavádění nástrojů pro rozvoj NDI zaměřených na interoperabilitu a uživatelský komfort
- Michal Kozubek (kozubek@fi.muni.cz)
Seznam členů pracovní skupiny
| Příjmení | Jméno | Instituce |
|---|---|---|
| Antol | Matej | Masarykova univerzita |
| Baldrian | Petr | MBÚ AV ČR, v.v.i. |
| BARTÁKOVÁ | Anna | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Bartoň | Vojtěch | Masarykova univerzita |
| Bednar | David | Masarykova univerzita |
| BENDOVÁ | Michaela | Univerzita Palackého v Olomouci |
| BENKOVÁ | Lucia | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Berka | Karel | UPOL Olomouc |
| Bouchal | Pavel | Masarykova univerzita |
| Božik | Matěj | CZU |
| Brůha | Petr | Zapadoceska univerzita |
| Bystrý | Vojtěch | Masarykova univerzita |
| Capandová | Michaela | Masarykova univerzita |
| CZERNEKOVÁ | Lýdie | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Černý | Jiří | BTÚ |
| DAS | Viswanath | Univerzita Palackého v Olomouci |
| DE SANCTIS | Juan Bautista | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Dědičová | Petra | FNUSA-ICRC |
| Dohnálek | Jan | Biotechnologický ústav Akademie věd České republiky, v. v. i. |
| Dohnalová | Michaela | Charles University |
| DRÁBEK | Jiří | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Dudová | Zdenka | Masarykova univerzita |
| Dvorský | Bohuslav | České vysoké učení technické v Praze |
| DŽUBÁK | Petr | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Ešner | Milan | Masarykova univerzita |
| Fasurová | Naděžda | Mendelova univerzita v Brně |
| Fousek | Jan | Masarykova univerzita |
| Franková | Věra | Charles University |
| FRYDRYCH | Ivo | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Fülöp | Jozef | Vysoka skola chemicko-technologicka v Praze |
| Galgonek | Jakub | Ústav organické chemie a biochemie AV ČR |
| GARMENDIA | Jenny Valentina | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Gharibian | Arootin | VSB - Technical University of Ostrava |
| Gombárová | Pavla | Ostravská univerzita |
| Gömöryová | Kristína | Masarykova univerzita |
| Grulich | Jiří | Charles University |
| GURSKÁ | Soňa | Univerzita Palackého v Olomouci |
| HAJDÚCH | Marián | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Haraštová | Iveta | ÚPT AVČR |
| HEFFNEROVÁ | Ema | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Hecht | Helge | Masarykova univerzita |
| Heizer | Tomáš | Charles University |
| HENDRYCHOVÁ | Romana | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Hlouchová | Klára | Charles University |
| HODOŇ | Jiří | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Hoksza | David | Charles University in Prague |
| Holešová | Eva | VSB - Technical University of Ostrava |
| Horáková | Barbora | Univerzita Hradec Králové |
| Horský | Vladimír | Masarykova univerzita |
| Horvath | Ondrej | Institute of Molecular Genetics of the Czech Academy of Sciences |
| Houdová | Lucie | Západočeská univerzita |
| Houser | Josef | Masarykova univerzita |
| Hradil | Ondřej | Masarykova univerzita |
| Hronová | Dita | Vysoka skola chemicko-technologicka v Praze |
| Hrstka | Roman | Masarykův onkologický ústav |
| Hrubá | Marika | Masarykův onkologický ústav |
| HRUŠKA | Miroslav | Univerzita Palackého v Olomouci |
| HUSÁRKOVÁ | Zuzana | Univerzita Palackého v Olomouci |
| CHRAPKOVÁ | Michaela | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Christian | Evzen | |
| Imramovská | Marta | FGÚ AV ČR v.v.i. |
| Jakubíčková | Markéta | Brno University of Technology |
| Jamárik | Jakub | Masarykova univerzita |
| Jarolímek | Jan | CZU |
| Jiřík | Radovan | Vysoké učení technické Brno |
| Kacová | Radoslava | Masarykova univerzita |
| Kadeřávek | Pavel | Masarykova univerzita |
| Kapytka | Maryia | Národní ústav duševního zdraví |
| Kauzlaričová | Terezie | VSB - Technical University of Ostrava |
| KINTLOVÁ | Martina | Univerzita Palackého v Olomouci |
| KIŠKA | Adam | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Kleibl | Zdeněk | Charles University |
| Kolářová | Kateřina | Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v. v. i. |
| KOSTELECKÁ | Vanesa | Univerzita Palackého v Olomouci |
| KOTKOVÁ | Lucie | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Koudelka | Vlastimil | Národní ústav duševního zdraví |
| KOUŘILOVÁ | Pavla | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Koutentaki | Georgia | České vysoké učení technické v Praze |
| Kovárník | Jaromír | Jihoceska univerzita v Ceskych Budejovicich |
| KOZLOV | Ihor | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Kozubek | Michal | Masarykova univerzita |
| KRAJČA | Jiří | Univerzita Palackého v Olomouci |
| KRASULOVÁ | Kristýna | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Kremláček | Jan | Charles University |
| KROUPOVÁ | Denisa | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Krzysztof Jesionek | Wojciech | Masarykova univerzita |
| LACEY | Matthew | Univerzita Palackého v Olomouci |
| LENART | Lukáš | Univerzita Palackého v Olomouci |
| LIŠKOVÁ | Barbora | Univerzita Palackého v Olomouci |
| LÖFFELMANN | Martin | Univerzita Palackého v Olomouci |
| LUZAROVÁ | Hana | Univerzita Palackého v Olomouci |
| MAHOLIAKOVÁ | Jana | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Mašek | Jan | Charles University |
| Matyska | Luděk | Masarykova univerzita |
| MEČIAROVÁ | Tatiana | Univerzita Palackého v Olomouci |
| MEDVEDÍKOVÁ | Martina | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Messerschmidt | Tomáš | Fakultni nemocnice Brno |
| Mikl | Michal | Masarykova univerzita |
| Mikšík | Daniel | Masarykova univerzita |
| Minibaeva | Guzel | Univerzita Palackého v Olomouci |
| MOUDRÝ | Pavel | Univerzita Palackého v Olomouci |
| MÜLLER | Martin | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Myslivcová Fučíková | Alena | Univerzita Hradec Králové |
| NAJDEKR | Lukáš | Univerzita Palackého v Olomouci |
| NEUŽILOVÁ | Barbora | Univerzita Palackého v Olomouci |
| NOVÝ | Zbyněk | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Oľha | Jaroslav | Masarykova univerzita |
| OMACHELOVÁ | Martina | Univerzita Palackého v Olomouci |
| ONDRA | Peter | Univerzita Palackého v Olomouci |
| OŽDIAN | Tomáš | Univerzita Palackého v Olomouci |
| PAVLIŠ | Petr | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Pernisová | Markéta | Masarykova univerzita |
| Plešingerová | Hana | Masarykova univerzita |
| Plevová | Karla | Masarykova univerzita |
| Pokluda | Robert | Mendelova univerzita v Brně |
| POKORNÁ | Jana | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Polishchuk | Pavlo | Univerzita Palackého v Olomouci |
| POPPER | Miroslav | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Potěšil | David | Masarykova univerzita |
| Prochazka | Jan | Institute of Molecular Genetics of the Czech Academy of Sciences |
| Procházková | Jiřina | Masarykova univerzita |
| Procházková Schrumpfová | Petra | Masarykova univerzita |
| PROTIVÁNKOVÁ | Iva | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Raček | Tomáš | Masarykova univerzita |
| RANC | Václav | Univerzita Palackého v Olomouci |
| ROČEK | Kateřina | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Rössner | Pavel | ÚEM AV ČR |
| Rošinec | Adrián | Masarykova univerzita |
| ROŽÁNKOVÁ | Zuzana | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Ruda | Miroslav | CESNET, zájmové sdružení právnických osob |
| Řiháčková | Katarína | Masarykova univerzita |
| SAEDI | Zeinab | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Sedlář | Karel | Vysoké učení technické v Brně |
| Sehnal | Luděk | Masarykova univerzita |
| SEKYROVÁ | Anna | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Schätz | Martin | Charles University |
| Sixtová | Nikola | ÚFCH JH AV ČR v.v.i. |
| SMITALOVÁ | Martina | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Snopková | Kateřina | Masarykova univerzita |
| Soldánová | Anna | KNAV |
| SPÍCHAL | Lukáš | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Spiwok | Vojtech | Vysoka skola chemicko-technologicka v Praze |
| SROVNAL | Josef | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Srutkova | Alzbeta | Institute of Molecular Genetics of the Czech Academy of Sciences |
| STEJSKAL | Pavel | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Stoklasa | Roman | Masarykova univerzita |
| Strachotova | Anna | Ústav organické chemie a biochemie AV ČR |
| Stránecký | Viktor | Charles University |
| STRÁNSKÁ | Jana | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Studnička | Filip | Univerzita Hradec Králové |
| Svoboda | Tomáš | Masarykova univerzita |
| Svobodova | Radka | Masarykova univerzita |
| Šafner | Marie | Ústav organické chemie a biochemie AV ČR |
| ŠAMAJ | Matej | Univerzita Palackého v Olomouci |
| ŠENKYŘÍKOVÁ | Markéta | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Šilerová | Alexandra | Masarykova univerzita |
| Šillerová | Martina | ÚPT AVČR |
| ŠKROTT | Zdeněk | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Škuta | Ctibor | Institute of Molecular Genetics of the Czech Academy of Sciences |
| Štorková | Nela | Charles University |
| TENGLER | Theodor | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Ulman | Vladimír | Masarykova univerzita |
| VÁCLAVKOVÁ | Jana | Univerzita Palackého v Olomouci |
| VALENTINI | Viktor | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Vaňáček | Pavel | Masarykova univerzita |
| Vaněčková | Libuše | Charles University |
| Vašina | Michal | Masarykova univerzita |
| Včelák | Petr | Zapadoceska univerzita |
| VIDLAŘOVÁ | Monika | Univerzita Palackého v Olomouci |
| VÍTEK | Dominik | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Vítková | Helena | Brno University of Technology |
| Volešák Francová | Pavla | Charles University |
| Vondrasek | Jiri | Ústav organické chemie a biochemie Akademie věd České republiky, v. v. i. |
| Vorsilak | Milan | Institute of Molecular Genetics of the Czech Academy of Sciences |
| Voršilák | Milan | Institute of Molecular Genetics of the Czech Academy of Sciences |
| Vrba | Zdeněk | Charles University |
| Vrbková | Jana | UPOL Olomouc |
| Wittner | Rudolf | Masarykova univerzita |
| ZIAEI | Nikta | Univerzita Palackého v Olomouci |