Bio/Health/Food
This working group integrates institutions and research infrastructures from the fields of life sciences, medicine, food and nutrition. Its objective is to establish a framework and set parameters for the implementation of EOSC in the Czech Republic.
It covers a wide range of scientific disciplines, from basic research with a systems biology approach, through translational and clinical research, new biotechnology specialisations, to food and nutrition in terms of safety and quality. It also purposefully maps the capacity of existing data resources in these fields, their metadata standards and procedures set up for managing, curating, sharing and accessing these resources.
The working group intersects with certain parts of environmental science, social science and humanities, addressing the health impact of other factors, such as the environment and its degradation or changes in socio-economic conditions. Another important collaboration is the connection with the Sensitive Data working group, which develops complex solutions to the ethical, legal and privacy requirements of data sharing in the aforementioned scientific fields.
Group Leader:
- Jiří Vondrášek, Institute of Organic Chemistry and Biochemistry of the CAS / ELIXIR-CZ
Deputy Group Leader:
- Radka Svobodová, Masaryk University
Secretary:
- Lenka Sedlačková (lenka.sedlackova@cesnet.cz)
Key Activities and Main Planned Outputs of Open Science II
Key Activity 2 – Thematic Cluster Bio/Health/Food (Jiří Vondrášek)
- 2.1 Czech Omics Node (OmiCZ)
- Vojtěch Bystrý (vojtech.bystry@ceitec.muni.cz)
- 2.2 Repository for Structural and Simulation Data (BioSimCZ)
- Radka Svobodová (radka.svobodova@ceitec.muni.cz; radka.svobodova@ceitec.muni.cz)
- 2.3 Repository for Human and Animal Imaging and Physiological Multimodal Data (Imaging Repository)
- Michal Mikl (michal.mikl@ceitec.muni.cz); Jan Fousek (jan.fousek@ceitec.muni.cz)
- 2.4 Repository for Chemical Biology Data and Its Integration with the Development and Training of AI Models (MS)
- Jakub Galgonek (jakub.galgonek@uochb.cas.cz)
- 2.5 Development of the ClinData Repository and FAIRification of Data
- Michaela Bendová (michaela.bendova@upol.cz); Marián Hajdúch (marian.hajduch@upol.cz)
- 2.6 Standardisation and Establishment of Procedures for Data Storage and Access Management
- Jakub Jamárik (jakub.jamarik@med.muni.cz)
- 2.7 Development and Pilot Implementation of Tools Supporting the Development of the National Data Infrastructure (NDI), Focused on Interoperability and User Experience
- Michal Kozubek (kozubek@fi.muni.cz)
List of Working Group Members
| Surname | Name | Institution |
|---|---|---|
| Antol | Matej | Masarykova univerzita |
| Baldrian | Petr | MBÚ AV ČR, v.v.i. |
| BARTÁKOVÁ | Anna | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Bartoň | Vojtěch | Masarykova univerzita |
| Bednar | David | Masarykova univerzita |
| BENDOVÁ | Michaela | Univerzita Palackého v Olomouci |
| BENKOVÁ | Lucia | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Berka | Karel | UPOL Olomouc |
| Bouchal | Pavel | Masarykova univerzita |
| Božik | Matěj | CZU |
| Brůha | Petr | Zapadoceska univerzita |
| Bystrý | Vojtěch | Masarykova univerzita |
| Capandová | Michaela | Masarykova univerzita |
| CZERNEKOVÁ | Lýdie | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Černý | Jiří | BTÚ |
| DAS | Viswanath | Univerzita Palackého v Olomouci |
| DE SANCTIS | Juan Bautista | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Dědičová | Petra | FNUSA-ICRC |
| Dohnálek | Jan | Biotechnologický ústav Akademie věd České republiky, v. v. i. |
| Dohnalová | Michaela | Charles University |
| DRÁBEK | Jiří | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Dudová | Zdenka | Masarykova univerzita |
| Dvorský | Bohuslav | České vysoké učení technické v Praze |
| DŽUBÁK | Petr | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Ešner | Milan | Masarykova univerzita |
| Fasurová | Naděžda | Mendelova univerzita v Brně |
| Fousek | Jan | Masarykova univerzita |
| Franková | Věra | Charles University |
| FRYDRYCH | Ivo | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Fülöp | Jozef | Vysoka skola chemicko-technologicka v Praze |
| Galgonek | Jakub | Ústav organické chemie a biochemie AV ČR |
| GARMENDIA | Jenny Valentina | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Gharibian | Arootin | VSB - Technical University of Ostrava |
| Gombárová | Pavla | Ostravská univerzita |
| Gömöryová | Kristína | Masarykova univerzita |
| Grulich | Jiří | Charles University |
| GURSKÁ | Soňa | Univerzita Palackého v Olomouci |
| HAJDÚCH | Marián | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Haraštová | Iveta | ÚPT AVČR |
| HEFFNEROVÁ | Ema | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Hecht | Helge | Masarykova univerzita |
| Heizer | Tomáš | Charles University |
| HENDRYCHOVÁ | Romana | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Hlouchová | Klára | Charles University |
| HODOŇ | Jiří | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Hoksza | David | Charles University in Prague |
| Holešová | Eva | VSB - Technical University of Ostrava |
| Horáková | Barbora | Univerzita Hradec Králové |
| Horský | Vladimír | Masarykova univerzita |
| Horvath | Ondrej | Institute of Molecular Genetics of the Czech Academy of Sciences |
| Houdová | Lucie | Západočeská univerzita |
| Houser | Josef | Masarykova univerzita |
| Hradil | Ondřej | Masarykova univerzita |
| Hronová | Dita | Vysoka skola chemicko-technologicka v Praze |
| Hrstka | Roman | Masarykův onkologický ústav |
| Hrubá | Marika | Masarykův onkologický ústav |
| HRUŠKA | Miroslav | Univerzita Palackého v Olomouci |
| HUSÁRKOVÁ | Zuzana | Univerzita Palackého v Olomouci |
| CHRAPKOVÁ | Michaela | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Christian | Evzen | |
| Imramovská | Marta | FGÚ AV ČR v.v.i. |
| Jakubíčková | Markéta | Brno University of Technology |
| Jamárik | Jakub | Masarykova univerzita |
| Jarolímek | Jan | CZU |
| Jiřík | Radovan | Vysoké učení technické Brno |
| Kacová | Radoslava | Masarykova univerzita |
| Kadeřávek | Pavel | Masarykova univerzita |
| Kapytka | Maryia | Národní ústav duševního zdraví |
| Kauzlaričová | Terezie | VSB - Technical University of Ostrava |
| KINTLOVÁ | Martina | Univerzita Palackého v Olomouci |
| KIŠKA | Adam | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Kleibl | Zdeněk | Charles University |
| Kolářová | Kateřina | Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v. v. i. |
| KOSTELECKÁ | Vanesa | Univerzita Palackého v Olomouci |
| KOTKOVÁ | Lucie | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Koudelka | Vlastimil | Národní ústav duševního zdraví |
| KOUŘILOVÁ | Pavla | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Koutentaki | Georgia | České vysoké učení technické v Praze |
| Kovárník | Jaromír | Jihoceska univerzita v Ceskych Budejovicich |
| KOZLOV | Ihor | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Kozubek | Michal | Masarykova univerzita |
| KRAJČA | Jiří | Univerzita Palackého v Olomouci |
| KRASULOVÁ | Kristýna | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Kremláček | Jan | Charles University |
| KROUPOVÁ | Denisa | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Krzysztof Jesionek | Wojciech | Masarykova univerzita |
| LACEY | Matthew | Univerzita Palackého v Olomouci |
| LENART | Lukáš | Univerzita Palackého v Olomouci |
| LIŠKOVÁ | Barbora | Univerzita Palackého v Olomouci |
| LÖFFELMANN | Martin | Univerzita Palackého v Olomouci |
| LUZAROVÁ | Hana | Univerzita Palackého v Olomouci |
| MAHOLIAKOVÁ | Jana | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Mašek | Jan | Charles University |
| Matyska | Luděk | Masarykova univerzita |
| MEČIAROVÁ | Tatiana | Univerzita Palackého v Olomouci |
| MEDVEDÍKOVÁ | Martina | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Messerschmidt | Tomáš | Fakultni nemocnice Brno |
| Mikl | Michal | Masarykova univerzita |
| Mikšík | Daniel | Masarykova univerzita |
| Minibaeva | Guzel | Univerzita Palackého v Olomouci |
| MOUDRÝ | Pavel | Univerzita Palackého v Olomouci |
| MÜLLER | Martin | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Myslivcová Fučíková | Alena | Univerzita Hradec Králové |
| NAJDEKR | Lukáš | Univerzita Palackého v Olomouci |
| NEUŽILOVÁ | Barbora | Univerzita Palackého v Olomouci |
| NOVÝ | Zbyněk | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Oľha | Jaroslav | Masarykova univerzita |
| OMACHELOVÁ | Martina | Univerzita Palackého v Olomouci |
| ONDRA | Peter | Univerzita Palackého v Olomouci |
| OŽDIAN | Tomáš | Univerzita Palackého v Olomouci |
| PAVLIŠ | Petr | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Pernisová | Markéta | Masarykova univerzita |
| Plešingerová | Hana | Masarykova univerzita |
| Plevová | Karla | Masarykova univerzita |
| Pokluda | Robert | Mendelova univerzita v Brně |
| POKORNÁ | Jana | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Polishchuk | Pavlo | Univerzita Palackého v Olomouci |
| POPPER | Miroslav | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Potěšil | David | Masarykova univerzita |
| Prochazka | Jan | Institute of Molecular Genetics of the Czech Academy of Sciences |
| Procházková | Jiřina | Masarykova univerzita |
| Procházková Schrumpfová | Petra | Masarykova univerzita |
| PROTIVÁNKOVÁ | Iva | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Raček | Tomáš | Masarykova univerzita |
| RANC | Václav | Univerzita Palackého v Olomouci |
| ROČEK | Kateřina | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Rössner | Pavel | ÚEM AV ČR |
| Rošinec | Adrián | Masarykova univerzita |
| ROŽÁNKOVÁ | Zuzana | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Ruda | Miroslav | CESNET, zájmové sdružení právnických osob |
| Řiháčková | Katarína | Masarykova univerzita |
| SAEDI | Zeinab | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Sedlář | Karel | Vysoké učení technické v Brně |
| Sehnal | Luděk | Masarykova univerzita |
| SEKYROVÁ | Anna | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Schätz | Martin | Charles University |
| Sixtová | Nikola | ÚFCH JH AV ČR v.v.i. |
| SMITALOVÁ | Martina | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Snopková | Kateřina | Masarykova univerzita |
| Soldánová | Anna | KNAV |
| SPÍCHAL | Lukáš | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Spiwok | Vojtech | Vysoka skola chemicko-technologicka v Praze |
| SROVNAL | Josef | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Srutkova | Alzbeta | Institute of Molecular Genetics of the Czech Academy of Sciences |
| STEJSKAL | Pavel | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Stoklasa | Roman | Masarykova univerzita |
| Strachotova | Anna | Ústav organické chemie a biochemie AV ČR |
| Stránecký | Viktor | Charles University |
| STRÁNSKÁ | Jana | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Studnička | Filip | Univerzita Hradec Králové |
| Svoboda | Tomáš | Masarykova univerzita |
| Svobodova | Radka | Masarykova univerzita |
| Šafner | Marie | Ústav organické chemie a biochemie AV ČR |
| ŠAMAJ | Matej | Univerzita Palackého v Olomouci |
| ŠENKYŘÍKOVÁ | Markéta | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Šilerová | Alexandra | Masarykova univerzita |
| Šillerová | Martina | ÚPT AVČR |
| ŠKROTT | Zdeněk | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Škuta | Ctibor | Institute of Molecular Genetics of the Czech Academy of Sciences |
| Štorková | Nela | Charles University |
| TENGLER | Theodor | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Ulman | Vladimír | Masarykova univerzita |
| VÁCLAVKOVÁ | Jana | Univerzita Palackého v Olomouci |
| VALENTINI | Viktor | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Vaňáček | Pavel | Masarykova univerzita |
| Vaněčková | Libuše | Charles University |
| Vašina | Michal | Masarykova univerzita |
| Včelák | Petr | Zapadoceska univerzita |
| VIDLAŘOVÁ | Monika | Univerzita Palackého v Olomouci |
| VÍTEK | Dominik | Univerzita Palackého v Olomouci |
| Vítková | Helena | Brno University of Technology |
| Volešák Francová | Pavla | Charles University |
| Vondrasek | Jiri | Ústav organické chemie a biochemie Akademie věd České republiky, v. v. i. |
| Vorsilak | Milan | Institute of Molecular Genetics of the Czech Academy of Sciences |
| Voršilák | Milan | Institute of Molecular Genetics of the Czech Academy of Sciences |
| Vrba | Zdeněk | Charles University |
| Vrbková | Jana | UPOL Olomouc |
| Wittner | Rudolf | Masarykova univerzita |
| ZIAEI | Nikta | Univerzita Palackého v Olomouci |